EDI là cần thiết để vận chuyển các dữ liệu cần thiết từ máy tính gửi qua các điểm trung gian bất kỳ tới máy tính nhận.

- Các giao thức cổ điển

+ X.400 e-mail tiêu chuẩn của ITU

+ OFTP 1 có thể sử dụng ISDN, TCP / IP, X.25 hoặc X.31 Fit

+ FTAM File Transfer truy cập và quản lý

- Ngoài ra, tất nhiên, có các "giao thức Internet" được sử dụng, đặc biệt là:

+ SMTP: Internet e-mail

+ HTTP

+ FTP: File Transfer Protocol

- Dựa trên giao thức Internet, có những tiêu chuẩn truyền thông ngoài việc vận chuyển dữ liệu còn có các tiêu chuẩn về mã hóa, xác thực và nén. Ví dụ như:

+ AS1 Internet EDIINT: Protocol (áp dụng SMTP)

+ AS2 Internet EDIINT: Protocol (áp dụng HTTP)

+ AS3 Internet EDIINT: Protocol (áp dụng FTP)

- EBICS Ngân hàng điện tử truyền thông Internet Standard (HTTP)

- OFTP2 Odette File Transfer: Protocol 2, dựa trên TCP / IP